Регулатори алтернатива полиаденилиране на тРНК

"Molecular машина" или фактори и ензими

Както бе споменато по-горе, се състои от две полиаденилиране etapov- рязане предварително иРНК и изграждане на поли (А) опашка. Обърнете внимание на факторите, свързани с тези процеси.
За рязане изисква разцепване / полиаденилиране фактор I (CPSF) (рязане фактор / полиаденилиране) и Разцепване фактор II (CF II), както е необходимо за запълване-поли (А) полимераза (поли (А) полимераза (Pap1)), фактор разцепване I (CF I), полиаденилиране фактор I (PF I) и Pab1 или Nab2 (вж. фигура). CF II, Pap1 и PF I може да се изолира като голям комплекс от CPF. Всички гени, участващи в този процес са идентифицирани чрез комбинация от биохимични и генетични методи.
движение:
Мултипротеинов комплекс осигурява рязане предварително иРНК от 15-30 нуклеотида на признати сайт CPSF. Най-често, сайтът съдържа AAUAAA-последователност, но може да има и други възможности, но свързване CPSF слабите. CstF (разцепване фактор стимулация, рязане фактор стимулация) се свързва в GU-богат регион на сайта. В мястото на третия признаване съдържащ UGUAA-последователност се свързва с ПС, който активира CPSF дори ако това не е свързано с AAUAAA. РНК се нарязва веднага след транскрипцията веднъж CstF свързва РНК полимераза II. В допълнение, рязането част CFII, но подробностите са все още неизвестни.

Когато приключите рязане, полиаденилационен ще започне да използва PAP. Това води до увеличаване на 3'-края на РНК AMP (аденозин монофосфат) от АТР. отцепване пирофосфат. РАВ2 свързано с нов кратко поли (А) опашка и PAP увеличава афинитет за РНК. Когато опашката достига дължина от около 250 нуклеотиди, ензимът губи комуникация с CPSF и полиаденилиращи спирки. CPSF в контакт с РНК полимераза II и транскрипционни ограничители. В допълнение, мултипротеинов комплекс svyazyvaetsyacherez CFI с spliceosome че премахва интрони от РНК.
Тази схема може да се представи по-:

Малко по-близък поглед към ПАП, която, по думите на професор Клер Мур от университета Тъфтс в Бостън, е един вид "сърцето" на тази молекулярна машина. Изследвания Claire Мур и Andrew Бом показват, че PAP състои от 3 домени на 150-200 аминокиселинни остатъци всяка. N-терминален домен принадлежи към семейството на трансферази и нуклеотиди съдържа триада на амино киселини характеристика. Тези, които участват в метален свързващ регулиран фосфатна група от АТР, и способни да позициониране на нуклеофилно 3'-ОН (хидрокси) праймер, което улеснява реакцията аминокиселини катализирани нуклеотидна трансфераза.
Средната PAP на домейна няма никаква структурна хомология с други протеини. Изследвания са показали, че участва във взаимодействието с фосфатна група от АТР и пирофосфат се отстранява, както и в транслокацията на РНК към следващия етап на полиаденилиране.
е необходим С-терминален домен за задържане на поли (А) - на праймера на място.

Около половината от гена, кодиращ протеин, имащ повече от един сайт на полиаденилиране. По този начин, един ген кодира няколко иРНКи, които се различават в техния 3 'край. В допълнение, заместник полиаденилирането променя дължината на 3'-нетранслиран участък, това може да повлияе свързващите места за микроРНК, съдържащи се в 3'-нетранслиран регион. микроРНК инхибират транслация на разграждане и стартиране иРНК, което е свързано с. Алтернативен полиаденилиране област може да бъде съкратен следователно иРНК кодираща синтезира друг пептид, по-кратък от оригиналните последователности, въпреки че това е по-често, отколкото отрязване 3'-нетранслиран участък.
Изборът на място за полиаденилиране възниква в зависимост от протеините, включени в него. Например, експресия на CstF-64 субединица CstF, увеличава в макрофаги в отговор на липополизахарид (компонент на бактериалната стена, която инициира имунен отговор). Този резултат избор слаб поли (А)-мястото синтеза и съответно кратко транскрипти отстраняване на регулаторни елементи в 3'-нетранслираната област на такива компоненти иРНК защита като лизозим и TNF-α. Тези иРНК-и имат по-голям продължителността на живота.

Алтернативен полиаденилиране за същия ген е характер тъканно-специфичен, освен това, че варира по време на живота на клетката. Според изследване на учени от Университета по медицина и стоматология на Ню Джърси могат да бъдат идентифицирани 42 различни вида алтернативна полиаденилация. Установено е, че в някои тъкани използва полиаденилиране с определено място в гена, например, локализиран сайтове в интрони или екзони и високи вътрешни сайтове в екзон локализирани близо до 3'-края. Също тъкан бяха открити (очните тъкани, ретината, плацента), които използват сайтове са рядко използвани в други тъкани. Той се анализира около 20 гена на протеинови продукти, които са включени в регулирането на полиаденилиране. Някои мозъчна тъкан демонстрират висока степен на съответствие с експресията на тези гени, но ниската степен на съгласуваност с други тъкани. При сравняване на геномни региони около поли (А) -sites, използвани главно в мозъчните тъкани, с области в други тъкани бяха идентифицирани някои цис-регулаторни последователности, специфично свързани с поли (А)-мястото използва в мозъчните тъкани.

Алтернативен poliadenilirovanie- е сложен процес, регулирането на които все още не е напълно ясно. Сега много лаборатории, ангажирани в изследвания на алтернативни полиаденилиране на тРНК синтезира от различни гени, например, NO-синтаза (ензимен синтез оксид azota- вещество, синтезирано в съдове и причинява тяхното разширяване), циклооксигеназа (ключов ензим в метаболизма на арахидоновата ksiloty от които синтезират възпалителни медиатори) и много други.
Тези проучвания neobhodmy, но в допълнение, трябва да:

1), за да се изследва регулаторните последователности

2) да разследва фактори, които участват в полиаденилационен

3) организира проучване полиаденилиране на тРНК синтезира с различни гени