Определяне на заряд на пептид молекула

Пептиди - органични съединения от аминокиселини. свързани с пептидни връзки.

Аминокиселините в по-голямата си част, такива молекули са:

Връзката на пептид се образува както следва:

R (радикал) може да бъде различен. Радикалите протеиногенни аминокиселини, които трябва да се научат, са представени в таблицата по-долу:

Съответно, за да се разбере как да се определи заряд на пептида, трябва първо да се справят с начина на определяне на заряд на аминокиселина. За това, помислете какво ще се случи с хистидин и неговото заплащане в зависимост от киселинността (рН).

Нека разгледаме няколко възможни варианти на киселинността на средата:

1. Много кисела среда (т.е. много Н + (протони)). На протоните са прикрепени към всички позиции, в които те могат да. За хистидинови такива разпоредби 3 - карбоксилна група, амино група и остатъкът от имидазол (пръстен в долната част на молекулата). Оказва се, че две положително заредена положението - амино група, и остатъкът имидазол. Т.е. общият заряд на хистидин в кисела среда е много 2+.

2. По-малко кисела среда близо до неутрално, да предположим, рН от около 5 (т.е. количеството на Н + се намалява). Протоните са вече не е достатъчно за карбоксилна група (първото нещо, на протона е винаги тя губи), но другите две разпоредби все още са протонирани.

3. неутрална среда и специален случай - изоелектричната точка (това съответства на хистидин при рН 7.6). Изоелектричната точка на аминокиселини заряд е нула. Протоните са само в амино група.

4. алкална среда (т.е., протони са много малки). Във всеки позиция не протони остава, което води до образуването на отрицателен заряд на молекулата.

Съответно, за да се определи заряд на пептида е необходимо да се определи заряд на аминокиселината влизат в състава си, в зависимост от киселинността на средата.

Какво зареждане ще има пептид, състоящ се от 3 хистидинови молекули в много кисела среда? За да направите това, нека да преброим колко позиции потенциално биха могли да бъдат протонирани (прикачите протон).

1. Две от 3-амино групите и две от три-карбоксилни групи са включени в образуването на пептидната връзка - не може да бъде протониран.

2. наличност остане една амино група, (N-края на пептида) и една карбоксилна група (С-края). Също така, 3 имидазол остатък.

N-терминалната амино група ще ни даде малко плюс три имидазол остатък три повече знака плюс, и карбоксил - нула.

Общо. зареждане на пептида His-His-му в кисела среда е много 4+

И това, което ще отговаря на пептида Gly-Gly в киселата среда? Повторете процедурата.

1. Две от 3-амино групите и две от три-карбоксилни групи са включени в образуването на пептидната връзка - не може да бъде протониран.

2. наличност остане една амино група, (N-края на пептида) и една карбоксилна група (С-края). Глицин радикал - Н. протониран не може.

N-терминалната амино група ще ни даде малко плюс три радикал ни три нули и карбокси друг нула.

Общо. зареждане на пептида Gly-Gly-Gly в кисела среда е равна 1+.

По този начин (на разглеждането избиратели) и пептид такса решен.